Összegzésként
A történet követi Medaka Kurokamit, a mágikus és vonzó Hakoniwa Akadémia elsőéves diákját, akit a szavazatok 98% -ával választottak meg a Diáktanács elnökévé. Ezekkel a petíciókkal nem megfelelő módon foglalkozik, és Zenkichi Hitoyoshi gyermekkori haverjával minden segítséggel javaslattételi dobozt állít fel. Az elbeszélés időtartama alatt a diáktanács vezetői helyeit ő osztja szét más tanulókkal, mint Mogana Kikaijima és Kouki Akune.
A Diáktanács megtudja, hogy az akadémia elnöke azt jelenti, hogy munkát kell kezdeményeznie a rutinos tanulók erőteljes kísérletezése érdekében, a Normál nevű lombiktervet, hogy rendellenesekké, vagyis emberfeletti erőkkel rendelkező emberekké alakíthassa őket. A Diáktanács konfliktusba kerül a többi diákkal, akik részt vesznek a munkában, és beszivárog az iskola titkos laboratóriumába.
Nem sokkal később Misogi Kumagawa, aki a Diáktanácsot a saját Medaka egyikével kívánja felváltani, kihívást jelent a Diáktanács bajnokságára. Hatalmából két tanuló nincs lezárva Kumagawa veresége után, és befejezi szállítását Hakoniwa Akadémiára. A kettő általában erősebb, mint az abnormális, és a „Nem egyenlő” névre hallgat. Vezérük, Anshin'in azzal fenyeget, hogy ha Medaka besorol, újraindítja a lombiktervet, és utódaikat a Diáktanács képezi ki. Mindazonáltal Anshin'in pontos stratégiája az lenne, ha a Zenkichi Hallgatói Tanácsának elnöke elbánja Medakát. Zenkichinek sikerrel jár, és úgy tesz, mintha a hallgatói életet javítaná. Meggyőzi Medakát, hogy engedélyezze a lombiktervet azok számára, akik nem hajlandók.
A Diáktanács elnökének felelősségéből átvett Medaka hamarosan részt vesz egy bajnokságban, hogy meghatározza férjét. Medaka lesz a győztes, aki úgy dönt, hogy feleségül veszi Zenkichit, miután mindketten osztályoznak, és belépnek önmagába. Röviddel ezután a zenkichi közeli Hansode Shiranui pali elhagyja az iskolát. Zenkichi és Medaka úgy találják, hogy végül az 5000 éves Iihiko Shishime másik házigazdája lesz. Medaka legyőzi és eltűnik, miután abbahagyta a Holdat, hogy lezuhanjon a Föld felé, egyszerűen azért, hogy időben megjelenjen az év végi szolgálatra. Visszatérését követően vállalja apja helyzetét családja vállalati konglomerátuma, a Kurokami Csoport előtt, hogy később visszatérjen, mivel az új elnök és Medaka úgy dönt, hogy elhagyja az akadémiát. Tíz évvel később Zenkichi a Kurokami-csoporton keresztül dolgozott, magas szintű munkássá vált, mielőtt újra találkozott volna, és mindketten megesküdtek, hogy soha többé nem válnak szét.